RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567947.1

CBFB-208, Transcript of core-binding factor subunit beta, human

TSL 3

Gene CBFB, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBFB-208	ENST00000567947	CD7	P09564	240 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	CECR9	P0C854	216 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	GLRX	P35754	106 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	EBI3	Q14213	229 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PLGLA	Q15195	96 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	S1PR3	Q99500	378 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	CCL19	Q99731	98 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		A0A087X002	238 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		A0A0B4J2C4	111 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		E7EQL1	145 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		F5H768	121 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		F8VRH5	84 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		H7C1H1	209 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	COX7C	P15954	63 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	CNTFR	P26992	372 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PSMB2	P49721	201 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	EFNA4	P52798	201 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	EMP1	P54849	157 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ATXN8	Q156A1	80 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		Q86TA4	180 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		Q8N8P6	123 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	DYSF	O75923	2080 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		D6R8Y8	96 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ATOX1	O00244	68 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	UPK2	O00526	184 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LYZL6	O75951	148 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	CKS2	P33552	79 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF138	P52744	262 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	HERVK_113	P63121	156 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PDE6H	Q13956	83 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		H3BMM0	161 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	FCGR3B	O75015	233 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TCL1B	O95988	128 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PPP1R17	O96001	155 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF137P	P52743	207 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	HERVK_113	P61574	105 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	AGRN	O00468	2067 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		A0A0J9YX75	114 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAC	P01848	142 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	GP9	P14770	177 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	PSMB8	P28062	276 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LEP	P41159	167 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LAGE3	Q14657	143 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83

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