RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 LIMD2Q9BT23 127 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 WFDC10AQ9H1F0 79 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 BTAF1O14981 1849 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 COL6A6A6NMZ7 2263 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 RREB1Q92766 1687 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MED12Q93074 2177 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CCDC18Q5T9S5 1454 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 hADV29S1A0JD25 119 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 HCG22E2RYF7 251 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IGLC1P0CG04 106 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 FAUP35544 74 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PI4KAP42356 2102 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 GNG11P61952 73 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SPRNQ5BIV9 151 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C5orf38Q86SI9 138 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 OR10AG1Q8NH19 301 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C4orf3Q8WVX3 66 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00312Q9Y6C7 94 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C10orf71Q711Q0 1435 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SCAPERQ9BY12 1400 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ADGRL2O95490 1459 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PTPRMP28827 1452 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 GOLGA3Q08378 1498 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 FYCO1Q9BQS8 1478 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 KDM3BQ7LBC6 1761 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRAV2A0A0B4J234 112 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 H3BQ15 152 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 H3BQF6 201 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ABCC5O15440 1437 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 HCRTO43612 131 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SSSCA1O60232 199 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IGHV3-33P01772 117 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CCKP06307 115 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SEC11AP67812 179 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MPV17LQ2QL34 196 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PYY3Q5JQD4 70 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C10orf128Q5T292 105 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SFTA2Q6UW10 78 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 COMMD6Q7Z4G1 85 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UBR1Q8IWV7 1749 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ODF3Q96PU9 254 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 BET1LQ9NYM9 111 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TET1Q8NFU7 2136 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ANKRD36A6QL64 1941 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SHROOM2Q13796 1616 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MED14O60244 1454 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TEX14Q8IWB6 1497 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DAPK1P53355 1430 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UQCRHLA0A096LP55 91 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NUPR2A6NF83 97 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NUPR1O60356 82 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CYB5AP00167 134 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IGLV3-1P01715 115 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UQCRHP07919 91 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NMBP08949 121 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 IL9P15248 144 aa0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms