RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.6□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.6□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 JPT2Q9H910 190 aa3.6□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 FAT1Q14517 4588 aa3.6□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 A0A0D9SG52 128 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 A0A1B0GV50 99 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 GAGE12JA6NER3 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 RHODO00212 210 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 PAGE4O60829 102 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 IGHV3-30P01768 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 IGHV3-33P01772 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 GAGE1Q13065 139 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 GAGE4Q13068 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 GAGE5Q13069 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 Q9HAA7 133 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 Q9UF83 564 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF39-211ENST00000556782 A0A087WWC5 75 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 M0R381 172 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PSCAO43653 123 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PFDN1O60925 122 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 CXCL1P09341 107 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PCP4P48539 62 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 XGP55808 180 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP10-1P60331 282 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 LAGE3Q14657 143 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 ZFP82Q8N141 532 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SFRP2Q96HF1 295 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PRSS47A8MTI9 375 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TMUB2Q71RG4 321 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 BAGE2Q86Y30 109 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 Q8N814 137 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 C11orf52Q96A22 123 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 MANBALQ9NQG1 85 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 EPM2AB3EWF7 344 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SNAI2O43623 268 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 OR5AL1P0C617 328 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RAB5CP51148 216 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 UBE2D3P61077 147 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 UBE2D2P62837 147 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 CCL20P78556 96 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 WFDC2Q14508 124 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PRR27Q6MZM9 219 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 NIT1Q86X76 327 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 DERL1Q9BUN8 251 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 GNG13Q9P2W3 67 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SULT1A2P50226 295 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RAB4BP61018 213 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF56Q15929 161 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 CENPWQ5EE01 88 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 A0A087WX48 190 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TEX46H3BTG2 121 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 LECT2O14960 151 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 PDE6DO43924 150 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 IGLV2-8P01709 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 IGLC6P0CF74 106 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 HAMPP81172 84 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 Q5VSD8 79 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 FRZBQ92765 325 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RMI2Q96E14 147 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SMIM12Q96EX1 92 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms