RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PAX4O43316 350 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 CRYBA4P53673 196 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TCTAP57738 103 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 RNF185Q96GF1 192 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NUPR2A6NF83 97 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TNP2Q05952 138 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 Q6ZTC4 211 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 PRELID3AQ96N28 172 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 ST20Q9HBF5 79 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 PRSS47A8MTI9 375 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 D6R8Y8 96 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 K7EMI3 77 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 HTN3P15516 51 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 G0S2P27469 103 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 COL7A1Q02388 2944 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 VCYO14598 125 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TNFRSF6BO95407 300 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 PMCHP20382 165 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 HOXA5P20719 270 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SRIP30626 198 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 RAB5BP61020 215 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 LINC01549A6NIU2 74 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NCR2O95944 276 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRGC2P03986 189 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 GYPEP15421 78 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 KIR2DL4Q99706 377 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 I3L3M4 83 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 TIRAPP58753 221 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 UBE2D3P61077 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 UBE2D2P62837 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 Q6ZSN1 163 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NRACQ8N912 160 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-220ENST00000550700 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 PKIAP61925 76 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 Q0VG73 95 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YY99 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAGE12JA6NER3 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 SMKR1H3BMG3 65 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 C3orf84H3BNL1 204 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 NPYP01303 97 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LINC00694P0DN24 101 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAGE1Q13065 139 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAGE4Q13068 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAGE5Q13069 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 COTL1Q14019 142 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAGE13Q4V321 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 Q8N8P6 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 MUC7Q8TAX7 377 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TMEM18Q96B42 140 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 IGLL5B9A064 214 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 H7C423 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 FCER1GP30273 86 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 FA2HQ7L5A8 372 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 BAGE3Q86Y29 109 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms