RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 FA2HQ7L5A8 372 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DEFB125Q8N687 156 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 C14orf144Q96I85 54 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 C9orf85Q96MD7 179 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.94□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.93□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 OR4C46A6NHA9 309 aa3.93□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.93□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 VAMP8Q9BV40 100 aa3.91□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.91□□□□□ -1.78
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TRDN-205ENST00000546248 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.89□□□□□ -1.79
TRDN-205ENST00000546248 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.89□□□□□ -1.79
TRDN-205ENST00000546248 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.89□□□□□ -1.79
TRDN-205ENST00000546248 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.89□□□□□ -1.79
TRDN-205ENST00000546248 PTH2Q96A98 100 aa3.89□□□□□ -1.79
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