RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

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Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 A6NDN8 102 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 CD28P10747 220 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 PRM2P04554 102 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 HTN1P15515 57 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 VAMP3Q15836 100 aa10.25□□□□□ -0.77
LIMK1-208ENST00000538333 TIMM17AQ99595 171 aa10.25□□□□□ -0.77
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LIMK1-208ENST00000538333 TMEM141Q96I45 108 aa10.24□□□□□ -0.77
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LIMK1-208ENST00000538333 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.23□□□□□ -0.77
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LIMK1-208ENST00000538333 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.22□□□□□ -0.77
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LIMK1-208ENST00000538333 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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LIMK1-208ENST00000538333 MTORP42345 2549 aa10.15□□□□□ -0.78
LIMK1-208ENST00000538333 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.15□□□□□ -0.79
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LIMK1-208ENST00000538333 IL17DQ8TAD2 202 aa10.15□□□□□ -0.79
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LIMK1-208ENST00000538333 K7ERJ3 54 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 RS1O15537 224 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 IGHV3-53P01767 116 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 HERVK_113P61574 105 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 FAM104AQ969W3 186 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 HIST1H4GQ99525 98 aa10.14□□□□□ -0.79
LIMK1-208ENST00000538333 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
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