RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557		K7EQM0	130 aa		7.43	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.43	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.43	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	H2BFS	P57053	126 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557		Q86TA4	180 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.42	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557		P01737	135 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	DEFA3	P59666	94 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	PKIA	P61925	76 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF56	Q15929	161 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.41	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZRP5	223 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	MPC2	O95563	127 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GUV1	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	S100Z	Q8WXG8	99 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PRE2	83 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	FAM231B	A6NCW3	169 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	PEX7	O00628	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	IFNA7	P01567	189 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	GZMB	P10144	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	SST	P61278	116 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	AQP10	Q96PS8	301 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0U1RQV1	116 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PNN7	141 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		F5H697	171 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2G2	P60604	165 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF726P1	Q15940	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		7.36	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557		M0QY20	66 aa		7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	CXorf1	O96002	111 aa		7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	PRR4	Q16378	134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.35	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	SNAI2	O43623	268 aa		7.34	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.34	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.34	□□□□□ -1.23
BBS1-222	ENST00000533557	FAM74A7	A6NL05	159 aa		7.33	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.33	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.33	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		7.33	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	LTA	P01374	205 aa		7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	SULT1A2	P50226	295 aa		7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	FOXI1	Q12951	378 aa		7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	CACNG7	P62955	275 aa		7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.3	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.3	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.3	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	FMC1	Q96HJ9	113 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC32	Q9BV29	185 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	MUC17	Q685J3	4493 aa		7.29	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	MGP	P08493	103 aa		7.28	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	CXCL1	P09341	107 aa		7.28	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	SERF2	P84101	59 aa		7.28	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
BBS1-222	ENST00000533557	MB	P02144	154 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	MT-ND6	P03923	174 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	AMT	P48728	403 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	DEFA1	P59665	94 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2G1	P62253	170 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	IFITM3	Q01628	133 aa		7.27	□□□□□ -1.25
BBS1-222	ENST00000533557	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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