RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	RAB4B	P61018	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	ELOB	Q15370	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	JPT2	Q9H910	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474		Q9HAA7	133 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1B0GV50	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	SNAI2	O43623	268 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	C1QB	P02746	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2D3	P61077	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	PKIA	P61925	76 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2D2	P62837	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	FOXI1	Q12951	378 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	NIT1	Q86X76	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		Q8N814	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RYR1	P21817	5038 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		A0A087WX48	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		F5H697	171 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	PDE6D	O43924	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	IFNA1	P01562	189 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	SULT1A2	P50226	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		Q0VG73	95 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF56	Q15929	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	FRZB	Q92765	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		Q9UF83	564 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		F2Z2F3	143 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	BCL2	P10415	239 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	GNG4	P50150	75 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	XG	P55808	180 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	CACNG7	P62955	275 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	CCL20	P78556	96 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		Q8N976	141 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		H7C1H1	209 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		P01737	135 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	CRP	P02741	224 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		Q5VSD8	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474		M0QY20	66 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	TRIAP1	O43715	76 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	MGP	P08493	103 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RCN1-208	ENST00000532474	WFDC2	Q14508	124 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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