RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 LY6G6DO95868 133 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-53P01767 116 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 DUX3Q96PT4 197 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.5□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 HSD52Q0P140 79 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 PMVKQ15126 192 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MAJINQ3KP22 176 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 PRR31Q5SQ13 230 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 Q8N3U1 123 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C18orf15Q96N68 181 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 LINC01587Q99440 93 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.49□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 F5H697 171 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CRLF1O75462 422 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 IGKV3-20P01619 116 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ZNF56Q15929 161 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 NFE4Q86UQ8 179 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 BAALCQ8WXS3 180 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C16orf74Q96GX8 76 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 DKK2Q9UBU2 259 aa5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 NACAE9PAV3 2078 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ACANP16112 2415 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 E9PLD3 99 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SAP30O75446 220 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.47□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 TENM4Q6N022 2769 aa5.46□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ZFHX3Q15911 3703 aa5.46□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.46□□□□□ -1.53
PACS1-211ENST00000531298 ITPR2Q14571 2701 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WWL8 130 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GV90 55 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 A6NDN8 102 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 C11orf86A6NJI1 115 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 H0Y8G0 127 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 H7C423 109 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TSHBP01222 138 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 HERVK_113P61574 105 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 CST9LQ9H4G1 147 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 JPT2Q9H910 190 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.46□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 SPRY2O43597 315 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 PF4P02776 101 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 P0DMU3 169 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 FAM231AP0DMU4 169 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 FAM231CP0DMU5 169 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 FXYD7P58549 80 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 STPG4Q8N801 248 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 AMELXQ99217 191 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 CITED1Q99966 193 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TM2D2Q9BX73 214 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.45□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.44□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 MTORP42345 2549 aa5.44□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.44□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.44□□□□□ -1.54
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PRX2 142 aa5.44□□□□□ -1.54
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