RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.62□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 PSMB2P49721 201 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 DEFB1P60022 68 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 C8orf49Q96NF6 230 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 K7EMT4 169 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 IFITM1P13164 125 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 KIR2DL4Q99706 377 aa9.61□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 DPM2O94777 84 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 C20orf173Q96LM9 149 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 LINC01619G3V211 115 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 TWIST1Q15672 202 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 AMN1Q8IY45 258 aa9.6□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 SNCGO76070 127 aa9.59□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATG13-211ENST00000528494 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 CKS2P33552 79 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 C16orf95Q9H693 158 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ATP5LO75964 103 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 CRIP1P50238 77 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LINC01559Q495D7 138 aa9.58□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 A8MWV9 139 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 F6UB75 175 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LGALS9O00182 355 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SOCS3O14543 225 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 NPYP01303 97 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LEPP41159 167 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 PRR25Q96S07 402 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SORL1Q92673 2214 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ASIPP42127 132 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.57□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SPXQ9BT56 116 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 Q6Q795 121 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.56□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LINC01549A6NIU2 74 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SMKR1H3BMG3 65 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 M0QXV9 152 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 CRLF1O75462 422 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 DCANP1Q8TF63 244 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 CCL24O00175 119 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 UBE2D3P61077 147 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 UBE2D2P62837 147 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SFTA2Q6UW10 78 aa9.55□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 H3BVH4 76 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 PROK1P58294 105 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TMEM126AQ9H061 195 aa9.54□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 LINC01546A6NGU7 62 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 NDUFA7O95182 113 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 RBAKDNA6NC62 111 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SH2D1AO60880 128 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 PEMTQ9UBM1 199 aa9.53□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.52□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 Q6ZQT7 251 aa9.52□□□□□ -0.88
ATG13-211ENST00000528494 KRTAP10-3P60369 221 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 C5orf47Q569G3 176 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 TCL1BO95988 128 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 ATRQ13535 2644 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 IGKV3-20P01619 116 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 ORM1P02763 201 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 OVOL1O14753 267 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 PLNP26678 52 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 UBE2D1P51668 147 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 K7EQG2 157 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 RASL10AQ92737 203 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 PRR9Q5T870 116 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 MDFICQ9P1T7 246 aa9.49□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ATG13-211ENST00000528494 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms