RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515365.1

HERC6-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, human

TSL 3

Gene HERC6, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC6-208	ENST00000515365		A0A0U1RQV1	116 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PGP	A6NDG6	321 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	C2orf70	A6NJV1	201 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ODF3B	A8MYP8	253 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		F2Z2F3	143 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		K7EMI3	77 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	DLEU1	O43261	78 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	NUPR1	O60356	82 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	IGKV1-17	P01599	117 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HLA-DRB1	P01911	266 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PPBP	P02775	128 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RD3L	P0DJH9	198 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	IGLC2	P0DOY2	106 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	UBE2G2	P60604	165 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HBB	P68871	147 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SLC35B1	P78383	322 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PSG9	Q00887	426 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	MUC15	Q8N387	334 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		Q8N6K4	173 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CCL17	Q92583	94 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	KCNS1	Q96KK3	526 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ST20	Q9HBF5	79 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		U3KQK5	164 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ABCA4	P78363	2273 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		A0A1B0GUT8	65 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LINC01549	A6NIU2	74 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HIGD1C	A8MV81	97 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		H3BRN7	92 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		K7EIM0	57 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SLC17A3	O00476	420 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		P01737	135 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	IGLC3	P0DOY3	106 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CCL3L1	P16619	93 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CBLN1	P23435	193 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	UBE2G1	P62253	170 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SYCN	Q0VAF6	134 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PLGLA	Q15195	96 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	VAMP3	Q15836	100 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PSG3	Q16557	428 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LTC4S	Q16873	150 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SPINK9	Q5DT21	86 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	FAM201A	Q5SY85	155 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	NIT1	Q86X76	327 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RPRML	Q8N4K4	120 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		Q8N9L7	120 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	NECAP1	Q8NC96	275 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LEAP2	Q969E1	77 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	BORCS7	Q96B45	105 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	VAMP8	Q9BV40	100 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	KMT2A	Q03164	3969 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	LINC01619	G3V211	115 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365		H3BUA1	57 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	C19orf84	I3L1E1	186 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	TCAP	O15273	167 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	TFF1	P04155	84 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	C3orf79	P0CE67	100 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	DEFA4	P12838	97 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SRI	P30626	198 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	CSN1S1	P47710	185 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	GNG10	P50151	68 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	POLE	Q07864	2286 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	TNXA	Q16473	311 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC6-208	ENST00000515365	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		2.55	□□□□□ -2

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