RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 F5H697 171 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHOX2AO14813 284 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UPK1BO75841 260 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CXCL1P09341 107 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMIM17P0DL12 118 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRIP1P50238 77 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 REG3AQ06141 175 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAGE6Q13070 117 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VAX2Q9UIW0 290 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM74A7A6NL05 159 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IQCJQ1A5X6 159 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR73Q6P4I2 378 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CFAP161Q6P656 301 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 REG3GQ6UW15 175 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF213Q63HN8 5207 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 H7C1H1 209 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LTAP01374 205 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKR1C3P42330 323 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFA1P59665 94 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFA3P59666 94 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STOML3Q8TAV4 291 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GTSF1Q8WW33 167 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AP1S3Q96PC3 154 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AQP10Q96PS8 301 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A0J9YXV3 536 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A1B0GUV1 79 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OR5AL1P0C617 328 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHTF8P0CG12 524 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FHITP49789 147 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM243Q9BU79 118 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNXBP22105 4242 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE2L6O14933 153 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNAI2O43623 268 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SULT1A2P50226 295 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAJINQ3KP22 176 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CST9LP1Q5W188 147 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COX6A2Q02221 97 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF726P1Q15940 193 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLPIP03973 132 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAB5CP51148 216 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STPG4Q8N801 248 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAS8-AS1O95177 125 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MGPP08493 103 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SSTP61278 116 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 M0QY20 66 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PFDN1O60925 122 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AMTP48728 403 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRTAP10-8P60410 259 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFITM3Q01628 133 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COTL1Q14019 142 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RASL11AQ6T310 242 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 Q6ZRP5 223 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BAGE2Q86Y30 109 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C15orf56Q8N910 161 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MED28Q9H204 178 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ODF1Q14990 250 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MLST8Q9BVC4 326 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 XKRY2A2RUG3 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM231BA6NCW3 169 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PAGE4O60829 102 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRGC1P0CF51 173 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CACNG7P62955 275 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms