RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01549A6NIU2 74 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BRN7 92 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EMI3 77 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TRACP01848 142 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 FCER1GP30273 86 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2D1P51668 147 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF329Q86UD4 541 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N1Y9 231 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA4O00483 81 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 PEX7O00628 323 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 DPM2O94777 84 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DMBP28068 263 aa5.48□□□□□ -1.53
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SMARCE1-211ENST00000493660 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS9O00182 355 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 P01737 135 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ACANP16112 2415 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HIVEP2P31629 2446 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 MORN5Q5VZ52 161 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 PAXXQ9BUH6 204 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 MLST8Q9BVC4 326 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 U3KQK5 164 aa5.46□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 GP9P14770 177 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 GPHB5Q86YW7 130 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01006Q8NI28 216 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL26Q96S19 204 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EMT4 169 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-11P01762 117 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD5Q96DB9 178 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 U3KQE9 123 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GUT8 65 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BMM0 161 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV12-3P01733 135 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF56Q15929 161 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2WQ96B02 151 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFHX3Q15911 3703 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf195Q5TG92 126 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01546A6NGU7 62 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 BUB3O43684 328 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 OXTP01178 125 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ACYP1P07311 99 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PYYP10082 97 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL5P42830 114 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PROK1P58294 105 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PDE6HQ13956 83 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf48Q96LS8 159 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf85Q96MD7 179 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PFN2P35080 140 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf173Q96LM9 149 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WW49 117 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QQQ9 107 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 ATOX1O00244 68 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 P0DMU3 169 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM231AP0DMU4 169 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM231CP0DMU5 169 aa5.43□□□□□ -1.54
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