RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK12Q9UKR0 248 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 CACNG7P62955 275 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 BLOC1S1P78537 153 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 F2Z2F3 143 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 MGPP08493 103 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 ELOBQ15370 118 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 RMI2Q96E14 147 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT11Q96G61 164 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM262E9PQX1 116 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 XGP55808 180 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC2Q14508 124 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2WQ96B02 151 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 COX11Q9Y6N1 276 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 LECT2O14960 151 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 OCC1Q8TAD7 63 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-211ENST00000493436 K7EN84 100 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TRGC1P0CF51 173 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM250H0YL14 139 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 H7C1H1 209 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 M0QY20 66 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 NTF3P20783 257 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 BAALCQ8WXS3 180 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1B0GVG6 124 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 CTRLP40313 264 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 Q0VG73 95 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 MPV17L2Q567V2 206 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR73Q6P4I2 378 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 EPM2AB3EWF7 344 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 PKIAP61925 76 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 CRPP02741 224 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 CEBPGP53567 150 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TWIST1Q15672 202 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 RASL11AQ6T310 242 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 HAMPP81172 84 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE6Q13070 117 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 ENHOQ6UWT2 76 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N976 141 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 CNFNQ9BYD5 112 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 IQCJQ1A5X6 159 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 NIT2Q9NQR4 276 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 RBX1P62877 108 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 GTSF1Q8WW33 167 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM231DQ6ZW35 169 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FRZBQ92765 325 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM210AQ96ND0 272 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM30AQ9NZY2 134 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 A8MWL6 223 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 MIAQ16674 131 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 Q5VSD8 79 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM243Q9BU79 118 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01620Q4KN68 170 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 GATD1Q8NB37 220 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR34Q9NV39 138 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF727A8MUV8 499 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 HLA-DQA1P01909 254 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 COTL1Q14019 142 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf177Q52M58 125 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CT83Q5H943 113 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01551Q86U37 167 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM229AH3BQW9 127 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms