RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 ENHOQ6UWT2 76 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRN-217ENST00000489650 SFRP2Q96HF1 295 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRN-217ENST00000489650 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRN-217ENST00000489650 SSTP61278 116 aa11.83□□□□□ -0.52
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PTPRN-217ENST00000489650 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.79□□□□□ -0.52
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PTPRN-217ENST00000489650 PRR34Q9NV39 138 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRN-217ENST00000489650 LRP2P98164 4655 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN-217ENST00000489650 OCC1Q8TAD7 63 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN-217ENST00000489650 NAT8Q9UHE5 227 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN-217ENST00000489650 XKRY2A2RUG3 117 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.77□□□□□ -0.53
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