RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489042.1

FBXO18-214, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-214ENST00000489042 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 F5H697 171 aa8.42□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 RAB4BP61018 213 aa8.42□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.42□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.42□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 TNXBP22105 4242 aa8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 ELOBQ15370 118 aa8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 HMSDA8MTL9 139 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 MGPP08493 103 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 RBX1P62877 108 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 BAGE2Q86Y30 109 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 MLST8Q9BVC4 326 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 TPPP3Q9BW30 176 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.4□□□□□ -1.06
FBXO18-214ENST00000489042 A0A0D9SG52 128 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SNAI2O43623 268 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 RAB5CP51148 216 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 CCL20P78556 96 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 Q0VG73 95 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 ZNF345Q14585 488 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.39□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SEC11BP0C7V7 166 aa8.38□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 OR5AL1P0C617 328 aa8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 CHTF8P0CG12 524 aa8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 RAB19A4D1S5 217 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 PFDN1O60925 122 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 C14orf177Q52M58 125 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 CENPWQ5EE01 88 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 TMUB2Q71RG4 321 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 GNG13Q9P2W3 67 aa8.36□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 CXCL1P09341 107 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SMIM17P0DL12 118 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 MIAQ16674 131 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 Q6ZNX1 250 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 AP1S3Q96PC3 154 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 PRR34Q9NV39 138 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 VAX2Q9UIW0 290 aa8.35□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 M0QY20 66 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 BCL2L11O43521 198 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 SLPIP03973 132 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.34□□□□□ -1.07
FBXO18-214ENST00000489042 hDV102S1A0JD36 115 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 UMAD1C9J7I0 102 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 OXTP01178 125 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 IGLC6P0CF74 106 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 REG3AQ06141 175 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 ODF1Q14990 250 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.33□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.32□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.32□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 MT1HL1P0DM35 61 aa8.32□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 IQCJQ1A5X6 159 aa8.32□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.32□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.31□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 LRP2P98164 4655 aa8.31□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.31□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 C11orf52Q96A22 123 aa8.31□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 TMEM243Q9BU79 118 aa8.3□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.29□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 A0A087WYN8 130 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 GNG4P50150 75 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 PKIAP61925 76 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 RASL11AQ6T310 242 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 C15orf56Q8N910 161 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 MANBALQ9NQG1 85 aa8.28□□□□□ -1.08
FBXO18-214ENST00000489042 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms