RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.88□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 SSTP61278 116 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 ESRGQ1W209 222 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.87□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTRLP40313 264 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF138P52744 262 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 KRTAP10-2P60368 255 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 CTAG1AP78358 180 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC01559Q495D7 138 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 NIT1Q86X76 327 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 GATD1Q8NB37 220 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 VAMP8Q9BV40 100 aa7.86□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 TTC32Q5I0X7 151 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 MUC21Q5SSG8 566 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 Q6ZTI0 123 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 UPK3BQ9BT76 320 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 C3orf79P0CE67 100 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 LEPP41159 167 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 TWIST1Q15672 202 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 Q8N1X5 172 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 ODF3Q96PU9 254 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.84□□□□□ -1.15
UBE2Q1-205ENST00000483639 H3BNG1 76 aa7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGLC6P0CF74 106 aa7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 FA2HQ7L5A8 372 aa7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.83□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 A0A096LPF7 62 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC00614P0C842 121 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 RAB4AP20338 218 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 PMCHL1Q16048 86 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 Q8N976 141 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C14orf144Q96I85 54 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.82□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C20orf202A1L168 122 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C7orf71A4D174 169 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 D6R8Y8 96 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC00315P59091 139 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 AMN1Q8IY45 258 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 ORMDL3Q8N138 153 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 PRELID3AQ96N28 172 aa7.81□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLLNB2CW77 178 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 OR5AL1P0C617 328 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPATA45Q537H7 98 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 Q6ZQT7 251 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC00477Q96M19 166 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C18orf15Q96N68 181 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMKR1H3BMG3 65 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LEPROTL1O95214 131 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCR2O95944 276 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 CKS2P33552 79 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 PRR9Q5T870 116 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATOH7Q8N100 152 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.79□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.78□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 H3BVH4 76 aa7.78□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGHV3-53P01767 116 aa7.78□□□□□ -1.16
UBE2Q1-205ENST00000483639 CACNG7P62955 275 aa7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126 ms