RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 COX6B1P14854 86 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZSV7 163 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV21A0A0B4J279 112 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01619G3V211 115 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NRGNQ92686 78 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.23□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CUBNO60494 3623 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF580Q9UK33 172 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGDP07320 174 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LMO4P61968 165 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM190Q8WZ59 177 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.22□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NPFFO15130 113 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2E1P51965 193 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RS1O15537 224 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N6K4 173 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN13Q12923 2485 aa12.21□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YXV3 536 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00477Q96M19 166 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRIAP1O43715 76 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ODF3Q96PU9 254 aa12.2□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC140Q96MF4 163 aa12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 DAND5Q8N907 189 aa12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 DUX5Q96PT3 197 aa12.19□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 VCYO14598 125 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TSHBP01222 138 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV12-3P01733 135 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.18□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2P5 195 aa12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.17□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 M0QXV9 152 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R17O96001 155 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf173Q96LM9 149 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 OOSP1A8MZH6 123 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5J2P56134 94 aa12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 A8MZ25 164 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS9O00182 355 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PF4V1P10720 104 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EBI3Q14213 229 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.15□□□□□ -0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BLCAPP62952 87 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCL19Q99731 98 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV41A0A0B4J266 112 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 H3BUX3 64 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM101Q96IK0 257 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.14□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BRI3O95415 125 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF876PQ49A33 203 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NAV2Q8IVL1 2488 aa12.13□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 IGIPA6NJ69 53 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00694P0DN24 101 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 H7C423 109 aa12.12□□□□□ -0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CD28P10747 220 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms