RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 A8MWV9 139 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 PPP1R17O96001 155 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP10-2P60368 255 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZSN1 163 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C3orf56Q8N813 242 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 NIT2Q9NQR4 276 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 MGPP08493 103 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM17P0DL12 118 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 FCER1GP30273 86 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 NACAE9PAV3 2078 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 A8MZ25 164 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 K7EMI3 77 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 LEPROTL1O95214 131 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 HBDP02042 147 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 C16orf74Q96GX8 76 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 Q9UF83 564 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-53P01767 116 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 KRTDAPP60985 99 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZTI0 123 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf118A6NHY6 69 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 RHODO00212 210 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 VCYO14598 125 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TCAPO15273 167 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 SCGB1D1O95968 90 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 LAGE3Q14657 143 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 RRN3P1Q2M238 152 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 C18orf15Q96N68 181 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ST20Q9HBF5 79 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 F5H697 171 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 P0DMU3 169 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 FAM231AP0DMU4 169 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 FAM231CP0DMU5 169 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF56Q15929 161 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 LINC01545Q5VT33 79 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 PET117Q6UWS5 81 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TSHBP01222 138 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 RIPPLY3P57055 190 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TOMM6Q96B49 74 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF479Q96JC4 524 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 H7C1H1 209 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 APOC4P55056 127 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 RNF183Q96D59 192 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 IGIPA6NJ69 53 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 I3L3M4 83 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 CIDEAO60543 219 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 S100A12P80511 92 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 ZMAT4Q9H898 229 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 G3V4G9 280 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 PKIAP61925 76 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 FHL2Q14192 279 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 RHOHQ15669 191 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 Q8NAQ8 132 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 FAM104AQ969W3 186 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 STAB1Q9NY15 2570 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 GAGE12BA1L429 117 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 ATP5LO75964 103 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA6-210ENST00000475302 GAGE7O76087 117 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms