RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PPBPP02775 128 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 X6R8D5 127 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 COTL1Q14019 142 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 RRN3P1Q2M238 152 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 APOC4P55056 127 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC00315P59091 139 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPB8Q9UJY1 196 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-204ENST00000452765 M0R2P5 195 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CKS2P33552 79 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 Q6ZTI0 123 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 AP1S3Q96PC3 154 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RETNQ9HD89 108 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CRYGDP07320 174 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 VAMP3Q15836 100 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TAX1BP3O14907 124 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SYT8Q8NBV8 401 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 IL17DQ8TAD2 202 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NPYP01303 97 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 OR11H2Q8NH07 326 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MPV17L2Q567V2 206 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 Q6ZVH6 145 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PRELID3AQ96N28 172 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RIPPLY3P57055 190 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 F5H697 171 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ORMDL3Q8N138 153 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 C16orf74Q96GX8 76 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 U3KQK5 164 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 K7EIL1 84 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM17P0DL12 118 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 IGHV3-53P01767 116 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC01545Q5VT33 79 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SPXQ9BT56 116 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NUDT3O95989 172 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 Q6ZSN1 163 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 Q9UF83 564 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 hDV102S1A0JD36 115 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GAGE12BA1L429 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GAGE7O76087 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GAGE12FP0CL80 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GAGE12GP0CL81 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GAGE12IP0CL82 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RASL10AQ92737 203 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF56Q15929 161 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF183Q96D59 192 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TNFRSF6BO95407 300 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 NRACQ8N912 160 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 P0DMU3 169 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM231AP0DMU4 169 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM231CP0DMU5 169 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MRAPQ8TCY5 172 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF479Q96JC4 524 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 A8MZ25 164 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 COX8AP10176 69 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SEC11AP67812 179 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CST9LQ9H4G1 147 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB130BP0DP73 79 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB130AP0DP74 79 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 COL7A1Q02388 2944 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 OCIAD2Q56VL3 154 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 Q8NAQ8 132 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 A8MWV9 139 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 RS1O15537 224 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 PTH2Q96A98 100 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 MRAP2Q96G30 205 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 CELA1Q9UNI1 258 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 M0QY20 66 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-204ENST00000452765 K7ERU9 68 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms