RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ANKRD39-202ENST00000443120 UPK3BQ9BT76 320 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD39-202ENST00000443120 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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ANKRD39-202ENST00000443120 TIMM17BO60830 172 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39-202ENST00000443120 NRACQ8N912 160 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39-202ENST00000443120 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39-202ENST00000443120 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD39-202ENST00000443120 MSMPQ1L6U9 139 aa11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.65□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 USP17L23D6RBM5 183 aa11.64□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.64□□□□□ -0.55
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ANKRD39-202ENST00000443120 NDUFC1O43677 76 aa11.63□□□□□ -0.55
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ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00694P0DN24 101 aa11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.63□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 ODF3Q96PU9 254 aa11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 ZMAT4Q9H898 229 aa11.62□□□□□ -0.55
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ANKRD39-202ENST00000443120 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 UBE2D1P51668 147 aa11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 GPHB5Q86YW7 130 aa11.62□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A0J9YX75 114 aa11.61□□□□□ -0.55
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ANKRD39-202ENST00000443120 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.61□□□□□ -0.55
ANKRD39-202ENST00000443120 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.61□□□□□ -0.55
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