RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV3-30P01768 117 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV3-33P01772 117 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB4BP61018 213 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNP2Q05952 138 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TWIST1Q15672 202 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COMMD7Q86VX2 200 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.38□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIRAPP58753 221 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LELP1Q5T871 98 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C6orf223Q8N319 242 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUP35Q8NFH5 326 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.37□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.37□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 F2Z2F3 143 aa6.36□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCR2O95944 276 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRGC1P0CF51 173 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM17P0DL12 118 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.36□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GATD1Q8NB37 220 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF185Q96GF1 192 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC32Q5I0X7 151 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AMN1Q8IY45 258 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GUT8 65 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.34□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR73Q6P4I2 378 aa6.34□□□□□ -1.39
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GXF2 115 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM218A2RU14 115 aa6.32□□□□□ -1.4
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC2Q14508 124 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UQCC3Q6UW78 93 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BORCS7Q96B45 105 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB4AP20338 218 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP10-2P60368 255 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIGQ13278 110 aa6.3□□□□□ -1.4
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 NIT2Q9NQR4 276 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAT1Q14517 4588 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H7C1H1 209 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HBBP68871 147 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NRACQ8N912 160 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLK12Q9UKR0 248 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A087WWC5 75 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSHBP01222 138 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IQCJQ1A5X6 159 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.27□□□□□ -1.41
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