RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GXF2 115 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MLST8Q9BVC4 326 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM89A2RUT3 159 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB4AO15263 64 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DAND5Q8N907 189 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK2AP2O75956 126 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf86A6NJI1 115 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5G1P05496 136 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ODF1Q14990 250 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 UBL5Q9BZL1 73 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TOMM6Q96B49 74 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MED14OSP0DP75 135 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYGBP07316 175 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 HERV-K104P63124 156 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB135Q30KP9 77 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHG4P01861 327 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS47A8MTI9 375 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 RS1O15537 224 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMM17AQ99595 171 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 PRORYQ9H606 182 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF1P05019 195 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 RMI2Q96E14 147 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 BAALC-AS2P0C853 105 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IFITM1P13164 125 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 HCFC1P51610 2035 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 E9PLD3 99 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-30P01768 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-33P01772 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 ZMAT4Q9H898 229 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 MYCNOSP40205 109 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 LY6LH3BQJ8 138 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 DSCR8Q96T75 97 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf153Q5TBE3 101 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 MBD6Q96DN6 1003 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 COX7A2LO14548 114 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 TAX1BP3O14907 124 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLC6P0CF74 106 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 HIGD1BQ9P298 99 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 FSTL3O95633 263 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 P0DMU3 169 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM231AP0DMU4 169 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM231CP0DMU5 169 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 EBI3Q14213 229 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 WFDC2Q14508 124 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYBA4P53673 196 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 COX7B2Q8TF08 81 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 CRIP1P50238 77 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf173Q96LM9 149 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EQG2 157 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB105AQ8NG35 78 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZTI0 123 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2BP63146 152 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms