RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 GAGE12JA6NER3 117 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 LINC00694P0DN24 101 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 HAMPP81172 84 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 GAGE1Q13065 139 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 GAGE4Q13068 117 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 GAGE5Q13069 117 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 GAGE13Q4V321 117 aa9.37□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 RHODO00212 210 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 TPPP3Q9BW30 176 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 BIN3Q9NQY0 253 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 FAT1Q14517 4588 aa9.35□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.35□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.35□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.34□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CITED1-202ENST00000373619 ZNF727A8MUV8 499 aa9.33□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 LINC01551Q86U37 167 aa9.33□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.33□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 GTSF1Q8WW33 167 aa9.33□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 HERC1Q15751 4861 aa9.33□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 XKRY2A2RUG3 117 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 F2Z2F3 143 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 NTF3P20783 257 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 RAB4BP61018 213 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 ELOBQ15370 118 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 Q8N976 141 aa9.32□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 CTRLP40313 264 aa9.31□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 CACNG7P62955 275 aa9.31□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 ZNF56Q15929 161 aa9.31□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 F5H697 171 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 PEA15Q15121 130 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 Q8N3U1 123 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 AP1S3Q96PC3 154 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.3□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 A0A087WX48 190 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 LECT2O14960 151 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 UBE2D3P61077 147 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 UBE2D2P62837 147 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 WDR73Q6P4I2 378 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 Q6ZSA8 131 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 CNFNQ9BYD5 112 aa9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 SMIM17P0DL12 118 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 IFITM2Q01629 132 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 C14orf177Q52M58 125 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 BAALCQ8WXS3 180 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 OSTCQ9NRP0 149 aa9.28□□□□□ -0.92
CITED1-202ENST00000373619 A8MWL6 223 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 M0QY20 66 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 MGPP08493 103 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 TWIST1Q15672 202 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 ISOC2Q96AB3 205 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 V9GYV3 84 aa9.27□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 Q0VG73 95 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 CT83Q5H943 113 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 NAT8Q9UHE5 227 aa9.26□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 TRGC1P0CF51 173 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 WFDC2Q14508 124 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 ADIRFQ15847 76 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 NIT1Q86X76 327 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 TSKUQ8WUA8 353 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 KLK12Q9UKR0 248 aa9.25□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 CRPP02741 224 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 PKIAP61925 76 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 SCXQ7RTU7 201 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 UBE2WQ96B02 151 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.24□□□□□ -0.93
CITED1-202ENST00000373619 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms