RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf49Q96NF6 230 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 GPHA2Q96T91 129 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 DKK2Q9UBU2 259 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 SPTA1P02549 2419 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0E1O15342 81 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 RNF144BQ7Z419 303 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 PROK2Q9HC23 129 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 RBX1P62877 108 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 ESM1Q9NQ30 184 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM223A0PJW6 202 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 ERC2-IT1O76042 136 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 COX7BP24311 80 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGF1P05019 195 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 MYCNOSP40205 109 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 VPREB1P12018 145 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WZ39 114 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TCL1BO95988 128 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 LIMD2Q9BT23 127 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 H3BTX0 84 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PSCAO43653 123 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1-17P01599 117 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 FXYD2P54710 66 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 BPY2O14599 106 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2D3P61077 147 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 B9D2Q9BPU9 175 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01548A6NM66 108 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-33P01772 117 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 Q8TAT8 98 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 DPH3Q96FX2 82 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV1-47P01700 117 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PCP2Q8IVA1 136 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SPTBN2O15020 2390 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CEP290O15078 2479 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV2-23P01705 113 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0J9YY99 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-53P01767 116 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-30P01768 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 hDV103S1A0JD37 113 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CTSGP08311 255 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ODF3BA8MYP8 253 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SMKR1H3BMG3 65 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV2-14P01704 120 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 WFDC2Q14508 124 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf38Q86SI9 138 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WWL8 130 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CGB3P0DN86 165 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CGB7P0DN87 165 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 HTN3P15516 51 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB131AP59861 70 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-48P01763 117 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZR03 302 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 NRGNQ92686 78 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PRO0628Q9UI54 55 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 OVOL3O00110 214 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-23P01764 117 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 Q8IZM0 81 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CCKP06307 115 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2D1P51668 147 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PRO0255Q9UI72 69 aa3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms