RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 Q6YL49 198 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-201ENST00000345716 IGLL5B9A064 214 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-201ENST00000345716 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-201ENST00000345716 HCFC1P51610 2035 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-201ENST00000345716 HERV-K104P63124 156 aa15.71■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 FXYD2P54710 66 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 ATP5G1P05496 136 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 C11orf86A6NJI1 115 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 SPART-AS1P0CW21 52 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 C20orf173Q96LM9 149 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 HIGD1BQ9P298 99 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 E9PLD3 99 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 CDSNQ15517 529 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 CRIP1P50238 77 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 ESM1Q9NQ30 184 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 A4D1N5 150 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 Q8N6K4 173 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 K7EQG2 157 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 IFITM1P13164 125 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 CRLF1O75462 422 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 MRAPQ8TCY5 172 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 LGALS9O00182 355 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 RMI2Q96E14 147 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.65■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.65■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.65■□□□□ 0.1
NISCH-201ENST00000345716 ODF3Q96PU9 254 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.64■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 DEFB135Q30KP9 77 aa15.63■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.63■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 IGLV2-11P01706 119 aa15.63■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 ZMAT4Q9H898 229 aa15.63■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 TAX1BP3O14907 124 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 DEFB4AO15263 64 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 COX7B2Q8TF08 81 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 Q9HAA7 133 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 DAND5Q8N907 189 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 COX7A2LO14548 114 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 P0DMU3 169 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 FAM231AP0DMU4 169 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 FAM231CP0DMU5 169 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 ZNF843Q8N446 348 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.59■□□□□ 0.09
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-30P01768 117 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-33P01772 117 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.58■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 UBL5Q9BZL1 73 aa15.57■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 INSL3P51460 131 aa15.56■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.56■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZSV7 163 aa15.56■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.55■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.55■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZTI0 123 aa15.55■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 TMEM126AQ9H061 195 aa15.55■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 PSMB8P28062 276 aa15.54■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 RPL32P62910 135 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZUT4 128 aa15.54■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.54■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.54■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 RNF185Q96GF1 192 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 HAMPP81172 84 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 DSCR8Q96T75 97 aa15.53■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 PRO0255Q9UI72 69 aa15.52■□□□□ 0.08
NISCH-201ENST00000345716 Q6ZS46 218 aa15.52■□□□□ 0.07
NISCH-201ENST00000345716 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.52■□□□□ 0.07
NISCH-201ENST00000345716 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms