RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRN3-201ENST00000308478 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRN3-201ENST00000308478 A0A0G2JNJ9 132 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DAND5Q8N907 189 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC140Q96MF4 163 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 Q9UFV3 132 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 A0A087WW49 117 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 A8MZ25 164 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 UQCRQO14949 82 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LINC00315P59091 139 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LST1O00453 97 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ATP6V0E1O15342 81 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 J3KT08 172 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LINC01600Q96MT4 127 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ZFHX3Q15911 3703 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 A0A0U1RRA0 63 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 RS1O15537 224 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 RHOHQ15669 191 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 Q8N9W7 124 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IMUPQ9GZP8 106 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 OVOL1O14753 267 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LITAFQ99732 161 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 CREBBPQ92793 2442 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 AKAP13Q12802 2813 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 hADV29S1A0JD25 119 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 B9A039 149 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGHV1-69P01742 117 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ACYP1P07311 99 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 KLRB1Q12918 225 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LY6DQ14210 128 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LINC00643Q86TS7 51 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 A0A0J9YX75 114 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 CD28P10747 220 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.68□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGKV3-20P01619 116 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 MED14OSP0DP75 135 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 MIAQ16674 131 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ODF3BA8MYP8 253 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 M0R1W7 72 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 COX7CP15954 63 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 Q8N6K4 173 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 U3KQE9 123 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 M0QY20 66 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 LINC01560Q8TB33 94 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV12-3P01733 135 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 DCANP1Q8TF63 244 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 SPANXCQ9NY87 97 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 COL12A1Q99715 3063 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 NXPH4O95158 308 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRACP01848 142 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.66□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 IGHV3-11P01762 117 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 HTN1P15515 57 aa4.65□□□□□ -1.66
LRRN3-201ENST00000308478 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms