RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 MLST8Q9BVC4 326 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.12■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 ODF3BA8MYP8 253 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 WISP2O76076 250 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM61Q8N0U2 210 aa16.11■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-30P01768 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-33P01772 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV12-3P01733 135 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC140Q96MF4 163 aa16.1■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 MRAPQ8TCY5 172 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 LECT2O14960 151 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGLC6P0CF74 106 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1AO00555 2505 aa16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCSAP-201ENST00000284617 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GX51 115 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 Q8NA96 180 aa16.08■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 ODF3Q96PU9 254 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 MBD6Q96DN6 1003 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 NREPQ16612 68 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 SS18L2Q9UHA2 77 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 TIRAPP58753 221 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 OBSL1O75147 1896 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 NRGNQ92686 78 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 G3V4G9 280 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG11BQ08648 103 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 FSTL3O95633 263 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB8P28062 276 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS5O43920 106 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC2BQ92478 149 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 ESM1Q9NQ30 184 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 LMO4P61968 165 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 PRO0255Q9UI72 69 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 MIAQ16674 131 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 MAP6D1Q9H9H5 199 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 DIRC1Q969H9 104 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 IGF1P05019 195 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-201ENST00000284617 TECTAO75443 2155 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa16.02■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 NCR3O14931 201 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 INSL3P51460 131 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZUT4 128 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB1O75438 58 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB135Q30KP9 77 aa16.01■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6GP18545 87 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 MP68P56378 58 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM20Q8N5G0 67 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 PRB1P04280 392 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 NFE4Q86UQ8 179 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 CUL9Q8IWT3 2517 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 KLK12Q9UKR0 248 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 HIVEP2P31629 2446 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGBP07316 175 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YXY3 114 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01548A6NM66 108 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G5P39877 138 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 PTH2Q96A98 100 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 K7EQG2 157 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 TM2D2Q9BX73 214 aa15.97■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 TCL1BO95988 128 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 EBI3Q14213 229 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00643Q86TS7 51 aa15.96■□□□□ 0.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 F8W735 103 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.95■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 YPEL4Q96NS1 127 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.94■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM131Q92545 1883 aa15.93■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 J3KT08 172 aa15.92■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB4AO15263 64 aa15.92■□□□□ 0.14
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.1 ms