RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 ZNF843Q8N446 348 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 CRYGDP07320 174 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 FOXI1Q12951 378 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 H7C2G1 150 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 TSHBP01222 138 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 MDFICQ9P1T7 246 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 PRM2P04554 102 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 APCP25054 2843 aa10.16□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 CRYBA4P53673 196 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SLURP1P55000 103 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 TOMM6Q96B49 74 aa10.15□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 C11orf86A6NJI1 115 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 KNCNA6PVL3 124 aa10.15□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 A0A087WW49 117 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 PRSS47A8MTI9 375 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TCL1BO95988 128 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TAL2Q16559 108 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.14□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 A0A1B0GV72 72 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 SCGB1A1P11684 91 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 HERVK_113P61574 105 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 SOCS3O14543 225 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 SPINK8P0C7L1 97 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 UBE2D1P51668 147 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 ZNF876PQ49A33 203 aa10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 Q8N1Y9 231 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 ZNF580Q9UK33 172 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 VCYO14598 125 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 DSCR9P59020 149 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 J3QR89 54 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 PPP1R17O96001 155 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 ELANEP08246 267 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 DEFB131AP59861 70 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 Q6ZUT4 128 aa10.11□□□□□ -0.79
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HERC5-201ENST00000264350 CFC1P0CG37 223 aa10.11□□□□□ -0.79
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HERC5-201ENST00000264350 A0A0J9YY99 117 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 RNF183Q96D59 192 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 RAX2Q96IS3 184 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 UBE2D3P61077 147 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 UBE2D2P62837 147 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 PMVKQ15126 192 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 A6NJY4 79 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC5-201ENST00000264350 P0DMU3 169 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 FAM231AP0DMU4 169 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 FAM231CP0DMU5 169 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 DCANP1Q8TF63 244 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 PRSS2P07478 247 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 Q1RN00 199 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 LINC00315P59091 139 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 H3BUA1 57 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 IGLV1-40P01703 118 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 AMELXQ99217 191 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 PSMB8P28062 276 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 IGHV3-30P01768 117 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 PROK1P58294 105 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 SPXQ9BT56 116 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC5-201ENST00000264350 KLLNB2CW77 178 aa10.06□□□□□ -0.8
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