RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.02□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.02□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.02□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.02□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 H3BRM9 83 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 Q8N1Y9 231 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CBY3A6NI87 242 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CCL25O15444 150 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TCTAP57738 103 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 Q6ZVH6 145 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 OR11H1Q8NG94 326 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 OR4C5Q8NGB2 326 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 PLA2G2AP14555 144 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 SLURP1P55000 103 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TMEM141Q96I45 108 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CR1P17927 2039 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 A0A087WWL8 130 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 AMTNQ6UX39 209 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 A8MTW9 85 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 ZNF56Q15929 161 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TAL2Q16559 108 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 BAALCQ8WXS3 180 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 MDFICQ9P1T7 246 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 DEFB131AP59861 70 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 C9orf118A6NHY6 69 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 OR11H12B2RN74 326 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 RIPPLY3P57055 190 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 ZNF876PQ49A33 203 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 OR11H2Q8NH07 326 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 JMJD8Q96S16 334 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TIMM17AQ99595 171 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 JPT2Q9H910 190 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CRYGDP07320 174 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 SMIM13P0DJ93 91 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 FOSL1P15407 271 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 RHOHQ15669 191 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 DEFB136Q30KP8 78 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-212ENST00000637083 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 H3BMM0 161 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 J3QKU1 62 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 AKAP9Q99996 3911 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 M0QY20 66 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 PMVKQ15126 192 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 RAX2Q96IS3 184 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 KNCNA6PVL3 124 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 E9PLD3 99 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 GCSHP23434 173 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 HERVK_113P61574 105 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 Q6ZSV7 163 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 PTH2Q96A98 100 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 TM2D2Q9BX73 214 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 IGIPA6NJ69 53 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 ZNF415Q09FC8 603 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 SCGB2A2Q13296 93 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 ITPR3Q14573 2671 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 MUC4Q99102 2169 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 GAGE10A6NGK3 116 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 A8MWV9 139 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN8-212ENST00000637083 I3L3M4 83 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.5 ms