RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MLST8Q9BVC4 326 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0J9YY99 117 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF843Q8N446 348 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB125Q8N687 156 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 IGLC6P0CF74 106 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 XCL1P47992 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 COX7B2Q8TF08 81 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 A0A096LPF7 62 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 E9PLD3 99 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 K7EP13 123 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 COX7A2LO14548 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 NUPR1O60356 82 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 H7C423 109 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 DOCK7Q96N67 2140 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 MDFICQ9P1T7 246 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 K7EQG2 157 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 GTF3C1Q12789 2109 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZQT7 251 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 PCP2Q8IVA1 136 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 CARD19Q96LW7 228 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 DSCR8Q96T75 97 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 CRLF1O75462 422 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 NXPH4O95158 308 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-228ENST00000636120 CCL18P55774 89 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 UBL5Q9BZL1 73 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 K7ERJ3 54 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 H0YGX0 51 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01548A6NM66 108 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MBD6Q96DN6 1003 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ACYP1P07311 99 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ODF1Q14990 250 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 U3KQK5 164 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SPRY2O43597 315 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM126AQ9H061 195 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS20P59510 1910 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 LYRM9A8MSI8 78 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CCL25O15444 150 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CRYBA4P53673 196 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MED12LQ86YW9 2145 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0J9YXV3 536 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGLL5B9A064 214 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 PSMB8P28062 276 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 PRO0255Q9UI72 69 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 C20orf173Q96LM9 149 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 AMTNQ6UX39 209 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 DOCK10Q96BY6 2186 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NPSP0C0P6 89 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF702PQ9H963 129 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 H3BMG7 143 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 YPEL4Q96NS1 127 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TM2D2Q9BX73 214 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFA1O15239 70 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 C5orf38Q86SI9 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV1-40P01703 118 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 F8W735 103 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IL17DQ8TAD2 202 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZSV7 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MRAPQ8TCY5 172 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.86□□□□□ -1.63
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