RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 ASIPP42127 132 aa14.77□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 MED14OSP0DP75 135 aa14.76□□□□□ -0.05
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CLN8-208ENST00000635751 LEPP41159 167 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 DEFB125Q8N687 156 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 NRACQ8N912 160 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 MRAP2Q96G30 205 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CLN8-208ENST00000635751 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.76□□□□□ -0.05
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CLN8-208ENST00000635751 GAGE1Q13065 139 aa14.74□□□□□ -0.05
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CLN8-208ENST00000635751 C18orf15Q96N68 181 aa14.72□□□□□ -0.05
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CLN8-208ENST00000635751 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-208ENST00000635751 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.71□□□□□ -0.06
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CLN8-208ENST00000635751 KIR3DS1Q14943 382 aa14.7□□□□□ -0.06
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CLN8-208ENST00000635751 AP1S3Q96PC3 154 aa14.67□□□□□ -0.06
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CLN8-208ENST00000635751 DKK2Q9UBU2 259 aa14.67□□□□□ -0.06
CLN8-208ENST00000635751 SMIM17P0DL12 118 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-208ENST00000635751 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.66□□□□□ -0.06
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CLN8-208ENST00000635751 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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CLN8-208ENST00000635751 COX11Q9Y6N1 276 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-208ENST00000635751 C7orf71A4D174 169 aa14.64□□□□□ -0.07
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CLN8-208ENST00000635751 K7EMI3 77 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.62□□□□□ -0.07
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CLN8-208ENST00000635751 DPM2O94777 84 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 KRTAP10-11P60412 298 aa14.6□□□□□ -0.07
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CLN8-208ENST00000635751 NMUP48645 174 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 TCTAP57738 103 aa14.59□□□□□ -0.07
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CLN8-208ENST00000635751 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-208ENST00000635751 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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