RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634285.1

DMD-231, Transcript of dystrophin, human

Gene DMD, Length 671 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-231	ENST00000634285	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	IGSF23	A1L1A6	192 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	KLLN	B2CW77	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SSSCA1	O60232	199 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CXorf1	O96002	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	IL4	P05112	153 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	OR4E1	P0C645	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SEC11B	P0C7V7	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LINC00869	P0C866	280 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TCL1A	P56279	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	MP68	P56378	58 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	RAB2A	P61019	212 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		Q5BKY6	102 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	AMTN	Q6UX39	209 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LINC01551	Q86U37	167 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	COMMD7	Q86VX2	200 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PRRT1	Q99946	306 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	RABAC1	Q9UI14	185 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ALG5	Q9Y673	324 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	HSPG2	P98160	4391 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	C7orf66	A4D0T2	115 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		H3BQ15	152 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		K7EPK0	472 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CST7	O76096	145 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	IFNA10	P01566	189 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TCRB	P04435	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	AZU1	P20160	251 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SNCA	P37840	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SULT1A2	P50226	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	BTN1A1	Q13410	526 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	C12orf74	Q32Q52	190 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PSMG4	Q5JS54	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ZFP82	Q8N141	532 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	OR11H2	Q8NH07	326 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	MGST2	Q99735	147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		G3V3Q6	166 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		H3BMM0	161 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	C3orf84	H3BNL1	204 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PANO1	I0J062	215 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		M0R2Z0	102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LYRM1	O43325	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SYNGR2	O43760	224 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	IFNA4	P05014	189 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CXCL3	P19876	107 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	H2BFS	P57053	126 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	DAD1	P61803	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	PRR9	Q5T870	116 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	MIC13	Q5XKP0	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SLC51B	Q86UW2	128 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	BAP18	Q8IXM2	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	TSC22D3	Q99576	134 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	APLN	Q9ULZ1	77 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ZNF98	A6NK75	572 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		H3BRN7	92 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285		M0R3E3	92 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	DHFR	P00374	187 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	ORM2	P19652	201 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DMD-231	ENST00000634285	NPPC	P23582	126 aa		2.72	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms