RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 JPT2Q9H910 190 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 A8MWV9 139 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R381 172 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SNAI2O43623 268 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 CIDEAO60543 219 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 CCL18P55774 89 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SYT8Q8NBV8 401 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 BIN3Q9NQY0 253 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL3L3-201ENST00000612839 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 K7EQD1 137 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 P01737 135 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5AL1P0C617 328 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GZMBP10144 247 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ESRGQ1W209 222 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP82Q8N141 532 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 NUDT11Q96G61 164 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 NAT8Q9UHE5 227 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 NXPH4O95158 308 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLC6P0CF74 106 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SFRP2Q96HF1 295 aa7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYGDP07320 174 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GYPEP15421 78 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RHEBQ15382 184 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZSN1 163 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WWL8 130 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01551Q86U37 167 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 XKRY2A2RUG3 117 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RHODO00212 210 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SRIP30626 198 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SSTP61278 116 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RHOHQ15669 191 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ADIRFQ15847 76 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 UPK3BQ9BT76 320 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TPPP3Q9BW30 176 aa7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WWC5 75 aa7.79□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R2N4 97 aa7.79□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.79□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 Q9UF83 564 aa7.79□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PPQ1 181 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 F2Z2F3 143 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ERVFC1-1P60608 527 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZR54 194 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GTSF1Q8WW33 167 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ISOC2Q96AB3 205 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 Q9H8V8 135 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.78□□□□□ -1.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 CTRLP40313 264 aa7.77□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.77□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.77□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00694P0DN24 101 aa7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNG7P62955 275 aa7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 AP1S3Q96PC3 154 aa7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 CNFNQ9BYD5 112 aa7.76□□□□□ -1.17
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms