RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01545Q5VT33 79 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 Q8N1Y9 231 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 RNF185Q96GF1 192 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 COX11Q9Y6N1 276 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.53□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.52□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 STHQ8IWL8 128 aa8.52□□□□□ -1.04
TOP3A-217ENST00000584582 RBAKDNA6NC62 111 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 COX8AP10176 69 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.52□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF815PA8K554 130 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 NPC2P61916 151 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PEMTQ9UBM1 199 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 P0DMU3 169 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 FAM231AP0DMU4 169 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 FAM231CP0DMU5 169 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 GATD1Q8NB37 220 aa8.51□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 HERVK_113P61574 105 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01619G3V211 115 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SMIM13P0DJ93 91 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 FABP2P12104 132 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 CCL25O15444 150 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PF4P02776 101 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 A0A096LNJ9 63 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 VCX2Q9H322 139 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 F8P00451 2351 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ELANEP08246 267 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 GPHB5Q86YW7 130 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 H7C1H1 209 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PSMB2P49721 201 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 UBE2V1Q13404 147 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 H3BUA1 57 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 VCYO14598 125 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PSMB8P28062 276 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 PROK1P58294 105 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 MRAP2Q96G30 205 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SPXQ9BT56 116 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 CD28P10747 220 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 HSD52Q0P140 79 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ODF1Q14990 250 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 RRN3P1Q2M238 152 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 RASL10AQ92737 203 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 J3QLI3 93 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 SMR3AQ99954 134 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
TOP3A-217ENST00000584582 A0A0J9YX75 114 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.46□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 AMTNQ6UX39 209 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 U3KQE9 123 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 PPP1R17O96001 155 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV1-40P01703 118 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 FXYD2P54710 66 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.45□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 F8VRH5 84 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 APCP25054 2843 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB130BP0DP73 79 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 DEFB130AP0DP74 79 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 Q6YL49 198 aa8.44□□□□□ -1.06
TOP3A-217ENST00000584582 DCANP1Q8TF63 244 aa8.44□□□□□ -1.06
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