RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 LY6DQ14210 128 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 Q9H8V8 135 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 J3QLI3 93 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZUT4 128 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM126AQ9H061 195 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 XCL2Q9UBD3 114 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0B4J2C4 111 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 SPRY2O43597 315 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 CITED1Q99966 193 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 H0YGX0 51 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 GNLYP22749 145 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 EML5Q05BV3 1969 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 LRP4O75096 1905 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 TCL1BO95988 128 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 RNF185Q96GF1 192 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 ODF3BA8MYP8 253 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 AJUBAQ96IF1 538 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 PFN2P35080 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 HTN3P15516 51 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 PTH2Q96A98 100 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 PLXNB1O43157 2135 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 ATOX1O00244 68 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 WISP2O76076 250 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 MDFICQ9P1T7 246 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 ATP5G1P05496 136 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 GPHB5Q86YW7 130 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N1Y9 231 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA25Q9BR10 227 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 SIRPDQ9H106 197 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 CNFNQ9BYD5 112 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM89A2RUT3 159 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 LY6LH3BQJ8 138 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 EBI3Q14213 229 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A0J9YY99 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 LGALS9O00182 355 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 U3KQE9 123 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGHG2P01859 326 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC140Q96MF4 163 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 ODF3Q96PU9 254 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-205ENST00000577827 MT-ATP8P03928 68 aa7.9□□□□□ -1.15
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PTPRM-205ENST00000577827 TTC28Q96AY4 2481 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 P0DMU3 169 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 FAM231AP0DMU4 169 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 FAM231CP0DMU5 169 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-205ENST00000577827 LINC00643Q86TS7 51 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-205ENST00000577827 DEFB130AP0DP74 79 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 RNF183Q96D59 192 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0J9YXY3 114 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 CRLF1O75462 422 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 TECTAO75443 2155 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0J9YX75 114 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-205ENST00000577827 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.88□□□□□ -1.15
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