RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 CRYGDP07320 174 aa12.92□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.92□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.92□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 IGIPA6NJ69 53 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N1Y9 231 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 E9PLD3 99 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 LGALS9O00182 355 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SAP30O75446 220 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 HIST1H4GQ99525 98 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.91□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 VCYO14598 125 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 DUX5Q96PT3 197 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 K7ERU9 68 aa12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 LINC01619G3V211 115 aa12.89□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF702PQ9H963 129 aa12.89□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 POLQO75417 2590 aa12.89□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 C12orf74Q32Q52 190 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 KIR2DL4Q99706 377 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 FSHBP01225 129 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ELANEP08246 267 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 Q6YL49 198 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 VPS25Q9BRG1 176 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.88□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 IGLL5B9A064 214 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ACACBO00763 2458 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 LINC01549A6NIU2 74 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 C11orf86A6NJI1 115 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 M0QY20 66 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 COX6B1P14854 86 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 RIPPLY3P57055 190 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 SYT8Q8NBV8 401 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.87□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 EMP1P54849 157 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 PMVKQ15126 192 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 AMTNQ6UX39 209 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 PRB1P04280 392 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM141Q96I45 108 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 TIMM17AQ99595 171 aa12.86□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 SORL1Q92673 2214 aa12.85□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF815PA8K554 130 aa12.85□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF56Q15929 161 aa12.85□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 CENPEQ02224 2701 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1B0GWB2 263 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 RNF152Q8N8N0 203 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF479Q96JC4 524 aa12.84□□□□□ -0.35
MEIS3-211ENST00000561204 CR1P17927 2039 aa12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 C18orf65Q6ZTR6 163 aa12.83□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 SCGB2A2Q13296 93 aa12.82□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF876PQ49A33 203 aa12.82□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.82□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 G3V4G9 280 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 SLURP1P55000 103 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB136Q30KP8 78 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 KRTAP10-9P60411 292 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 RRN3P1Q2M238 152 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.81□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 KNCNA6PVL3 124 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 P0DMU3 169 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 FAM231AP0DMU4 169 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 FAM231CP0DMU5 169 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 HERVK_113P61574 105 aa12.8□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 LRRK2Q5S007 2527 aa12.79□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.79□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 RHOHQ15669 191 aa12.79□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms