RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 FHL2Q14192 279 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 EVI2AP22794 236 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 AP1S3Q96PC3 154 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 IMMP2LQ96T52 175 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIGQ13278 110 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUC7Q8TAX7 377 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRGC1P0CF51 173 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP6V1G1O75348 118 aa13.11□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC00315P59091 139 aa13.11□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.11□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.11□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q6ZSN1 163 aa13.11□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1B0GXF2 115 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 RHODO00212 210 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CIDEAO60543 219 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM17P0DL12 118 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAMPP49913 170 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.1□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0J9YY99 117 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 S100PP25815 95 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 BTF3L4Q96K17 158 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 MGPP08493 103 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRYBA4P53673 196 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF56Q15929 161 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRO0255Q9UI72 69 aa13.08□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 HBBP68871 147 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.07□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1B0GW15 77 aa13.06□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUPR2A6NF83 97 aa13.06□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGLL5B9A064 214 aa13.06□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 F5H697 171 aa13.06□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAX4O43316 350 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLAQ13239 276 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 STARD9Q9P2P6 4700 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB4BP61018 213 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELOBQ15370 118 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMN1Q8IY45 258 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q9UF83 564 aa13.05□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 S100A8P05109 93 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 P0DMU3 169 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM231AP0DMU4 169 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM231CP0DMU5 169 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 S100A1P23297 94 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 GATD1Q8NB37 220 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF185Q96GF1 192 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 K7EQD1 137 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 RHOHQ15669 191 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM210BQ96KR6 192 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCO1O75880 301 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GYPEP15421 78 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB4AP20338 218 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 YPEL4Q96NS1 127 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 C3orf84H3BNL1 204 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASC10Q5T4H9 136 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 TENM2Q9NT68 2774 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BNG1 76 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 M0QY20 66 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAS8-AS1O95177 125 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUDT3O95989 172 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASL11AQ6T310 242 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 APLNQ9ULZ1 77 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A096LPF7 62 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAGE12JA6NER3 117 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAGE1Q13065 139 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAGE4Q13068 117 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAGE5Q13069 117 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms