RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 RAB4BP61018 213 aa12.95□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 DKK2Q9UBU2 259 aa12.95□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 APCSP02743 223 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 PPBPP02775 128 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 CRYGDP07320 174 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 Q6ZTI0 123 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 RETNQ9HD89 108 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 MUC4Q99102 2169 aa12.94□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00315P59091 139 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 SSTP61278 116 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 MRAP2Q96G30 205 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 RNF185Q96GF1 192 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.93□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 PHOX2AO14813 284 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 RAB4AP20338 218 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 SLAQ13239 276 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 AMN1Q8IY45 258 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 U3KQK5 164 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 RYR3Q15413 4870 aa12.92□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 TRGC2P03986 189 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 EMP1P54849 157 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 OR4C5Q8NGB2 326 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.91□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 JPT2Q9H910 190 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.9□□□□□ -0.34
MFGE8-210ENST00000559259 TENM3Q9P273 2699 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE12BA1L429 117 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE7O76087 117 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R17O96001 155 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE12FP0CL80 117 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE12GP0CL81 117 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE12IP0CL82 117 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.89□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 A0A087WWL8 130 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 C1orf196B1AJZ1 125 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 ORMDL3Q8N138 153 aa12.88□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 H7C1H1 209 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 IGHV3-53P01767 116 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 DAD1P61803 113 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.87□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB4AO15263 64 aa12.86□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 MGPP08493 103 aa12.86□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 CKS2P33552 79 aa12.86□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB130BP0DP73 79 aa12.85□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 DEFB130AP0DP74 79 aa12.85□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF56Q15929 161 aa12.85□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF479Q96JC4 524 aa12.85□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 CELA1Q9UNI1 258 aa12.85□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 A0A0J9YWU9 116 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 D6R8Y8 96 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 F5H697 171 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 M0QY20 66 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 ATP5G1P05496 136 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 RAB5BP61020 215 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.84□□□□□ -0.35
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.83□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PRSS47A8MTI9 375 aa12.83□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PRELID3AQ96N28 172 aa12.83□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SRIP30626 198 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 FHL2Q14192 279 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 C12orf74Q32Q52 190 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NRACQ8N912 160 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 C20orf78Q9BR46 151 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.82□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 Q0VG73 95 aa12.81□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.81□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NIT2Q9NQR4 276 aa12.81□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BKO60814 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TNFRSF6BO95407 300 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BJP06899 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BOP23527 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BBP33778 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BDP58876 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST1H2BCP62807 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.8□□□□□ -0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms