RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559143.1

MFGE8-209, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 358 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-209ENST00000559143 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 K7EQD1 137 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 ISOC2Q96AB3 205 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 AP1S3Q96PC3 154 aa6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 TRGC1P0CF51 173 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 GYPEP15421 78 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 SRIP30626 198 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 RAB4BP61018 213 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 TSKUQ8WUA8 353 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 LYSTQ99698 3801 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 RYR2Q92736 4967 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 NACAE9PAV3 2078 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00694P0DN24 101 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 GZMBP10144 247 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 ESRGQ1W209 222 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 JPT2Q9H910 190 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 V9GYV3 84 aa6.4□□□□□ -1.38
MFGE8-209ENST00000559143 A0A087WWL8 130 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 K7EP13 123 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SMIM17P0DL12 118 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 ADIRFQ15847 76 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GTSF1Q8WW33 167 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TPPP3Q9BW30 176 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TENM2Q9NT68 2774 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00862A6NCI5 91 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 PPP1R2P9O14990 202 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 NTF3P20783 257 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 LINC00315P59091 139 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TTC32Q5I0X7 151 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 Q6ZSN1 163 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 FRZBQ92765 325 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 BORCS7Q96B45 105 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.38□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 HIGD1CA8MV81 97 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 H7C1H1 209 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 ZNF56Q15929 161 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 Q6ZR54 194 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 Q9H8V8 135 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.37□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 A0A087WWC5 75 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 A0A1B0GUT8 65 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TMEM218A2RU14 115 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 EVI2AP22794 236 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TWIST1Q15672 202 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 LELP1Q5T871 98 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SEC11CQ9BY50 192 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 RYR3Q15413 4870 aa6.36□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 KMT2AQ03164 3969 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 A0A1B0GW15 77 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE12JA6NER3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 M0QY20 66 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SIVA1O15304 175 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 UBE2D3P61077 147 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 UBE2D2P62837 147 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE1Q13065 139 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE4Q13068 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE5Q13069 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 GAGE13Q4V321 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 COMMD7Q86VX2 200 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 NUP35Q8NFH5 326 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.35□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.34□□□□□ -1.39
MFGE8-209ENST00000559143 F5H697 171 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms