RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 EMP1P54849 157 aa14.87□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TM2D2Q9BX73 214 aa14.87□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF580Q9UK33 172 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087WW49 117 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0J9YX75 114 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSHBP01222 138 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.86□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR11H12B2RN74 326 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRYGDP07320 174 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR11H1Q8NG94 326 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR11H2Q8NH07 326 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 FABP2P12104 132 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q8N1Y9 231 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIST1H4GQ99525 98 aa14.85□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 K7EQG2 157 aa14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 DSCR9P59020 149 aa14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.84□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKAP9Q99996 3911 aa14.83□□□□□ -0.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R17O96001 155 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS25Q9BRG1 176 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.83□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.82□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 C9orf85Q96MD7 179 aa14.82□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFB136Q30KP8 78 aa14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGIPA6NJ69 53 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 C11orf86A6NJI1 115 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF56Q15929 161 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF702PQ9H963 129 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 E9PLD3 99 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRTAP10-9P60411 292 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 C12orf74Q32Q52 190 aa14.8□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 CR1P17927 2039 aa14.79□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.79□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIR2DL4Q99706 377 aa14.79□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 K7ERU9 68 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 VCYO14598 125 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGLL5B9A064 214 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 LGALS9O00182 355 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 NF1P21359 2839 aa14.78□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF815PA8K554 130 aa14.77□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 HTN1P15515 57 aa14.77□□□□□ -0.04
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM89A2RUT3 159 aa14.77□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRM2P04554 102 aa14.77□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAL2Q16559 108 aa14.77□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ODF3Q96PU9 254 aa14.77□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 M0QY20 66 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLURP1P55000 103 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q6YL49 198 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHD6Q8TD26 2715 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 KNCNA6PVL3 124 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 J3QLI3 93 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 DUX3Q96PT4 197 aa14.76□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 COX6B1P14854 86 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCGB2A2Q13296 93 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF876PQ49A33 203 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMTNQ6UX39 209 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF479Q96JC4 524 aa14.75□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ELANEP08246 267 aa14.74□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 PMVKQ15126 192 aa14.74□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.74□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.74□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYT8Q8NBV8 401 aa14.74□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms