RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 A8MWV9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 HOXA5P20719 270 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 X6R8D5 127 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 F5H697 171 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 CRYGDP07320 174 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF56Q15929 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 SERF1AO75920 110 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAS8-AS1O95177 125 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NPYP01303 97 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 EMP1P54849 157 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZWC4 215 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 OR11H2Q8NH07 326 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 RASL10AQ92737 203 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRR-209ENST00000549308 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRR-209ENST00000549308 TNFRSF6BO95407 300 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 S100A2P29034 98 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00315P59091 139 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZTI0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 RNF183Q96D59 192 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NIT1Q86X76 327 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12BA1L429 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 RHODO00212 210 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NUPR1O60356 82 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE7O76087 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12FP0CL80 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12GP0CL81 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12IP0CL82 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00310P59036 64 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 NRACQ8N912 160 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 MIFP14174 115 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 FA2HQ7L5A8 372 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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PTPRR-209ENST00000549308 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRR-209ENST00000549308 PPP1R17O96001 155 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 ESDP10768 282 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 K7EIL1 84 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-53P01767 116 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00614P0C842 121 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM18Q96B42 140 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 RETNQ9HD89 108 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRR-209ENST00000549308 H7C1H1 209 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB4AO15263 64 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 FABP4P15090 132 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRR-209ENST00000549308 AKR1D1P51857 326 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRR-209ENST00000549308 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 C20orf78Q9BR46 151 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 IFITM10A6NMD0 228 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 LYRM9A8MSI8 78 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS47A8MTI9 375 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 Q8N8P6 123 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.62□□□□□ -1.03
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