RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	CCL18	P55774	89 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	SPX	Q9BT56	116 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	GNG13	Q9P2W3	67 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048		B4DEV8	164 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	UMAD1	C9J7I0	102 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PFDN1	O60925	122 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	NXPH4	O95158	308 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ORM1	P02763	201 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	CRYGD	P07320	174 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	GZMB	P10144	247 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PTH2	Q96A98	100 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	KCNS1	Q96KK3	526 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PARL	Q9H300	379 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048		A0A087WWL8	130 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048		K7EQM0	130 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	AKR1C3	P42330	323 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PPT1	P50897	306 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00315	P59091	139 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	SST	P61278	116 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	AKAP14	Q86UN6	197 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	BAGE2	Q86Y30	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf52	Q96A22	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-234	ENST00000546048	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048		C9JQL5	133 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	TEX46	H3BTG2	121 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048		K7EN84	100 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048		M0R381	172 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SIVA1	O15304	175 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SRI	P30626	198 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	ASIP	P42127	132 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	UBE2G1	P62253	170 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	GAGE1	Q13065	139 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	GAGE4	Q13068	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	GAGE5	Q13069	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SNAI2	O43623	268 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	BCL2	P10415	239 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	RAB5C	P51148	216 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SLA	Q13239	276 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048		A8MWV9	139 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MDM2-234	ENST00000546048	TIRAP	P58753	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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