RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 YPEL4Q96NS1 127 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1B0GXF2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 MDFICQ9P1T7 246 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 PATE2Q6UY27 113 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-33P01772 117 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-216ENST00000545170 OBSL1O75147 1896 aa6.65□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.65□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.65□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.65□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LY6HO94772 140 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 EBI3Q14213 229 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q8N976 141 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 MYO7AQ13402 2215 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 H7C423 109 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q6JHZ5 121 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00311Q8N616 119 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 SPRY4Q9C004 299 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 NACAE9PAV3 2078 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM223A0PJW6 202 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 ANK1P16157 1881 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 NDUFA1O15239 70 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-30P01768 117 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 GYPEP15421 78 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 SPAG11BQ08648 103 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PRAC2D3DTV9 90 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LCTP09848 1927 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q6ZS92 163 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 A8MZ25 164 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 RNF114Q9Y508 228 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 APOC4P55056 127 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C4orf26Q17RF5 130 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q8TCH9 128 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C3orf84H3BNL1 204 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q0VFX4 171 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 I3L2K1 104 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 J3QLI3 93 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PRORYQ9H606 182 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 DKK4Q9UBT3 224 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 TSC2P49815 1807 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 B4DSR2 109 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV2-23P01705 113 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 MED14OSP0DP75 135 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 A0A0G2JNJ9 132 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PLA2G5P39877 138 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 Q9UFV3 132 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LST1O00453 97 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV2-8P01709 118 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 DSCR9P59020 149 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV3-1P01715 115 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 COL4A1P02462 1669 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 E7EQL1 145 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 PRYO14603 147 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 GATA4P43694 442 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 C16orf74Q96GX8 76 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 RITA1Q96K30 269 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.59□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 CCKP06307 115 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 SIRPDQ9H106 197 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 A0A087WVE0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 227.8 ms