RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R17O96001 155 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 AMTNQ6UX39 209 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 RASL10AQ92737 203 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 C18orf15Q96N68 181 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB131AP59861 70 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 BATFQ16520 125 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB114Q30KQ6 69 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 ATRQ13535 2644 aa14.96□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.96□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf85Q96MD7 179 aa14.96□□□□□ -0.01
PACSIN3-211ENST00000539589 KNCNA6PVL3 124 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TCAPO15273 167 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5LO75964 103 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DRB4P13762 266 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 Q8N1Y9 231 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT8Q8NBV8 401 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MDFICQ9P1T7 246 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 K7EMI3 77 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00315P59091 139 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 VWFP04275 2813 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MTW9 85 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BMM0 161 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDT3O95989 172 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS1P07477 247 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 JPT2Q9H910 190 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 DKK2Q9UBU2 259 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 COX8AP10176 69 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MUC4Q99102 2169 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087WWL8 130 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ODF1Q14990 250 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-211ENST00000539589 MAST4O15021 2626 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CBY3A6NI87 242 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 F5H697 171 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF124Q15973 351 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 STPG4Q8N801 248 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CSTL1Q9H114 145 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMAT4Q9H898 229 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TOMM6Q96B49 74 aa14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF876PQ49A33 203 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CITED1Q99966 193 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SAP30O75446 220 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKCP01834 107 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 DPM2O94777 84 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYGDP07320 174 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 G0S2P27469 103 aa14.83□□□□□ -0.03
PACSIN3-211ENST00000539589 VCYO14598 125 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 HTN1P15515 57 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF56Q15929 161 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087WX48 190 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV1-51P01701 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PF4P02776 101 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF6P10767 208 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MPV17L2Q567V2 206 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms