RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536393.5

USP30-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 30, human

TSL 5

Gene USP30, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP30-208	ENST00000536393	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393		A6NDX4	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393		M0QY20	66 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ELANE	P08246	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	MGP	P08493	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	FXYD7	P58549	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TIRAP	P58753	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	CFHR3	Q02985	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TCF15	Q12870	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	SPX	Q9BT56	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.99	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	SNCG	O76070	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TSHB	P01222	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	PSMB2	P49721	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393		S4R3C0	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ACACA	Q13085	2346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393		G3V318	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393		K7EQG2	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TCL1B	O95988	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	HERV-K104	P63124	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAGE5	Q13069	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAGE6	Q13070	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	LY6D	Q14210	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	PRR9	Q5T870	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	ROS1	P08922	2347 aa		4.96	□□□□□ -1.61
USP30-208	ENST00000536393	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		B4DSR2	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		H7C423	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	PSMB8	P28062	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	MIA	Q16674	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	XP32	Q5T750	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	CITED1	Q99966	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		A4D1N5	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		F5H697	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		H3BMM0	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	HERVK_113	P63121	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	ZNF56	Q15929	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393		Q8N3U1	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	FRYL	O94915	3013 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	APC2	O95996	2303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	LST1	O00453	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	NDUFA1	O15239	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP30-208	ENST00000536393	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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