RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.72□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 F8VRH5 84 aa7.71□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV3P03979 118 aa7.71□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00694P0DN24 101 aa7.71□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N8P6 123 aa7.71□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01587Q99440 93 aa7.71□□□□□ -1.17
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV2-23P01705 113 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ECSCRQ19T08 205 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 MDFICQ9P1T7 246 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ELANEP08246 267 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 PRR25Q96S07 402 aa7.71□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 RELNP78509 3460 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZS46 218 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00311Q8N616 119 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 LAGE3Q14657 143 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 H7C1H1 209 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-59P01825 116 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ORM1P02763 201 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 Q6Q795 121 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 H7C2G1 150 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 NBR2O15453 112 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-17P01599 117 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 PF4V1P10720 104 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 CNTFRP26992 372 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 S4R3C0 116 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 AVPP01185 164 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 EMP1P54849 157 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 NRACQ8N912 160 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01559Q495D7 138 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DMBP28068 263 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YY99 117 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 RNF5Q99942 180 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 H3BRN7 92 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf47Q569G3 176 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 DLX6P56179 175 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM126AQ9H061 195 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ITPR2Q14571 2701 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 MAST4O15021 2626 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV1-47P01700 117 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-30P01768 117 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 CNFNQ9BYD5 112 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM86BQ8N661 226 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 IGHG4P01861 327 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF56Q15929 161 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 BAALCQ8WXS3 180 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 ERCC8Q13216 396 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 Q6YL49 198 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 I3L2K1 104 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 CFHR4Q92496 578 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 RNF125Q96EQ8 232 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 SPRY2O43597 315 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 ODF3BA8MYP8 253 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 PF4P02776 101 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 DUX3Q96PT4 197 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-211ENST00000520276 A4D1N5 150 aa7.62□□□□□ -1.19
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