RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PCP2Q8IVA1 136 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PLA2G2AP14555 144 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM86BQ8N661 226 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N2B8 174 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 RAX2Q96IS3 184 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC4Q99102 2169 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HIVEP2P31629 2446 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01587Q99440 93 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01546A6NGU7 62 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS47A8MTI9 375 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 VCYO14598 125 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PTTG1IPP53801 180 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 NPSP0C0P6 89 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CD28P10747 220 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WX48 190 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BMM0 161 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 H7C1H1 209 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CCL24O00175 119 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ESM1Q9NQ30 184 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PRM2P04554 102 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HLA-DRB4P13762 266 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SCGB2A2Q13296 93 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 COX11Q9Y6N1 276 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB125Q8N687 156 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf85Q96MD7 179 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 AMTNQ6UX39 209 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TOMM6Q96B49 74 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 NXPH4O95158 308 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 XCL2Q9UBD3 114 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 F8VRH5 84 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EMI3 77 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 GCSHP23434 173 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PLNP26678 52 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00315P59091 139 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 STHQ8IWL8 128 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-208ENST00000510829 A6NDN8 102 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FGF6P10767 208 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 EMP1P54849 157 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
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RABGEF1-208ENST00000510829 HSD52Q0P140 79 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RAB37Q96AX2 223 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 OR11H12B2RN74 326 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SAP30O75446 220 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 OR11H2Q8NH07 326 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NACAE9PAV3 2078 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ITPR2Q14571 2701 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 CRYGDP07320 174 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF415Q09FC8 603 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01006Q8NI28 216 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ZMAT4Q9H898 229 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 INSP01308 110 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SEC11AP67812 179 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 BAALCQ8WXS3 180 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE1Q13065 139 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NF1P21359 2839 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 M0QY20 66 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.12□□□□□ -1.11
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