RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497121.1

CPS1-208, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, human

TSL 4

Gene CPS1, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPS1-208	ENST00000497121	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	GAGE1	Q13065	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	GAGE4	Q13068	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	GAGE5	Q13069	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121		A0A1B0GV50	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	AKR1C3	P42330	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	UBE2G1	P62253	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1-208	ENST00000497121		A0A087WWL8	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RHOD	O00212	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	EREG	O14944	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	CXCL1	P09341	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	WFDC2	Q14508	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121		M0R381	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	SNAI2	O43623	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	LAGE3	Q14657	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121		Q8N814	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121		Q9HAA7	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121		A0A087WWC5	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	GCSH	P23434	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	UBE2D3	P61077	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	UBE2D2	P62837	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	NIT1	Q86X76	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	SULT1A2	P50226	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RAB5C	P51148	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RAB4B	P61018	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	PSCA	O43653	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RAB14	P61106	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPS1-208	ENST00000497121	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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