RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 V9GYY9 64 aa5.54□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LCE2BO14633 110 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZS46 218 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ODF3Q96PU9 254 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 IMUPQ9GZP8 106 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 F8W735 103 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5LO75964 103 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 NPYP01303 97 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV3P03979 118 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 HILS1P60008 231 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf32Q32M92 178 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01559Q495D7 138 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01600Q96MT4 127 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 SMR3AQ99954 134 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMAT4Q9H898 229 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 EPDR1Q9UM22 224 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-211ENST00000493660 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-17P01599 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-48P01763 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ELANEP08246 267 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF138P52744 262 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF152Q8N8N0 203 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H4GQ99525 98 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 COX7A2P2O60397 106 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HBDP02042 147 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYGAP11844 174 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB8P28062 276 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM258P61165 79 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF415Q09FC8 603 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ESM1Q9NQ30 184 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZANQ9Y493 2812 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A096LNJ9 63 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CD7P09564 240 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 EDN2P20800 178 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 C4orf26Q17RF5 130 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 Q5XG85 94 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00477Q96M19 166 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC140Q96MF4 163 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf95Q9H693 158 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF492Q9P255 531 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CTSGP08311 255 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZSV7 163 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 RBAKDNA6NC62 111 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 PATE2Q6UY27 113 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 DPH3Q96FX2 82 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 INAFM1C9JVW0 142 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BVH4 76 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A20O43772 301 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKCP01834 107 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 COX7CP15954 63 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 AMN1Q8IY45 258 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 JPT2Q9H910 190 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 S4R3C0 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 OVOL1O14753 267 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TCL1BO95988 128 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-23P01764 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LYZP61626 148 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TWIST1Q15672 202 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF503Q96F45 646 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK15Q9H2R5 256 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 DKK2Q9UBU2 259 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-211ENST00000493660 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms